Pandemian aaltojen hallinnan vaikeuksien tärkeimpiä syitä taitavat olla koronaviruksen muunnokset. Etenkin brittimuunnoksen hanakampi tarttuvuus on muuttanut taudin epidemiologiaa. Brittimuunnos ehti ilmeisesti levitä laajasti jo ennen kuin siihen herättiin, arvioi viruksen liikkeitä mallintanut monikansallinen tutkimusryhmä.
Ensimmäinen potilas, jolta myöhemmin tunnistettiin brittivariantti, sairastui syyskuussa 2020 Kentissä Englannissa. Vasta joulukuussa asiasta nousi yleisempi häly. Tutkimuksessa mallinnettiin variantin leviämistä syyskuusta joulukuuhun käyttämällä kriteereinä variantin suhteellista esiintymistä ja Englannista muihin maihin tehtyjä matkoja. Kohdemaita oli 15, Yhdysvaltojen ja Intian lisäksi 13 Euroopan maata.
Laskelmat osoittivat, että brittimuunnos levisi ensimmäisenä Irlantiin, ja suurella todennäköisyydellä se oli marraskuun puolivälissä jo jokaisessa 15 maassa. Yhdysvalloissakin sitä oli jo lokakuun puolivälissä, noin kaksi kuukautta ennen kuin siitä tiedettiin.
Vastaisen varalta mallinnusryhmä on julkaissut Texasin yliopiston sivuilla laskurin (https://covid-19.tacc.utexas.edu/dashboards/variants/). Se kertoo esimerkiksi, montako kantaa täytyy sekvensoida, jotta uusi variantti löytyy 1 000 infektion joukosta. Se vaatii kuulemma 3 000 sekvenssiä viikossa.
Du Z, Wang L, Yang B ym. Risk for international importations of variant SARS-CoV-2 originating in the United Kingdom. Emerg Inf Dis, verkossa ensin 24.3.2021. doi: 10.3201/eid2705.210050
Heikki Arvilommi
Uutinen on julkaistu aiemmin Lääkärilehdessä 16/2021.
